使用方法
1．File Uploadボタンをクリックして、自分のコンピュータの中のメタゲノム配列データを選択します。.fastq,.fq,fastq.gz,fq.gzファイル形式のみアップロード可能です。拡張子が.fastq,.fq,fastq.gz,fq.gzになっている必要があります。無圧縮ファイルの場合は先頭の40MB、圧縮ファイルの場合は先頭の10MBの中からランダムに最大10万リードを抽出してからアップロードするため、比較的短時間でアップロードが完了します。
2. 結果を受信するためのメールアドレスを入力します。
3．Uploadボタンをクリックします。サーバーでの処理が終了すると、結果ページのURLが、入力したメールアドレスに送信されます。サーバでの解析が完了し、メールが届くまで10分ほど時間がかかります。その間、ブラウザは閉じてしまって良いです。
結果の見方
SILVA、PR2、ミトコンドリア全長、MitoFishデータベースにblastnを用いて相同性検索を行い、LCA（lowest-common ancestor）法を用いて分類群に割り当てた結果がKronaで表示されます。得られた微生物の組成と、SRA, ERA, DRAの公共データベースに登録されているメタゲノムデータから最も近いメタゲノムデータを検索し、棒グラフで表示します。データの類似度の指標としては、デフォルトはWeighted UniFrac類似度で計算します。ほかにも相関係数、Jaccard類似度、Weighted Jaccard類似度、UniFrac類似度の結果も閲覧可能です。類似度は1に近いほど似ているデータとなります。UnweightedのJaccard類似度、UniFrac類似度は1％以上の割合を占める生物を用いて検索します。